Geopal
Construction d’une librairie de séquences du gène 16S rRNA de qualité internationale pour évaluer l’impact des contaminations fécales humaines et non-humaines sur les surfaces de la métropole de Lyon et les eaux de ruissellement
- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données de séquençage du segment V4 de du gène de l’ARNr 16S pour les fèces d'un ensemble d''êtres vivants (homme, chien, chat...)
- FORMAT : Tableau Excel contenant le descriptif des échantillons, et les tables de contingence.
- CONTEXTE :
Ces données ont été produites dans le cadre des activités de l'OTHU et s'inscrit dans les travaux multidisciplinaires de BPOE-LEM. Le but est la création d'une base de données de référence du gène 16S rRNA pour pouvoir par la suite identifier les sources de contamination fécales dans la métropole de Lyon. Cette base de données sera enrichie au cours du temps dès lors que nous parviendrons à obtenir de nouveaux échantillons.
Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans.
- LIEU : Métropole de Lyon, Auvergne
- PÉRIODE : 2025-maintenant
Simple
- Date (Revision)
- 2025-04
- Purpose
- construction d’une librairie de séquences du gène 16S rRNA de qualité internationale
- Status
- Under development
- Maintenance and update frequency
- Continual
- GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
-
- Installations de suivi environnemental
- GEMET
-
- pollution
- micro-organisme
- eau
- bactérie fécale
- theme.OZCAR-Theia.rdf
-
- Bacteria and virus diversity
- Bacteria and virus abundance
- Keywords
-
- SNO Observil
- ZABR
- Emprises du Grand Lyon et périphériques
-
- MARCY-L'ETOILE
- LYON
- Use limitation
- Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif
- Access constraints
- Copyright
- Use constraints
- Other restrictions
- Other constraints
- Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention
Spatial resolution
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Topic category
-
- Environment
- Inland waters
- Begin date
- 2025-01-01
- Description
- LYON
))
- Description
- LYON
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- Description
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- Description
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- Description
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- Description
- LYON
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- Description
- MARCY-L'ETOILE
))
- Distribution format
-
-
txt/csv
(
)
-
txt/csv
(
)
- OnLine resource
- Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
- OnLine resource
-
OTHU site web
(
WWW:LINK-1.0-http--related
)
OTHU site web
- Hierarchy level
- Dataset
Conformance result
- Date (Publication)
- 2010-11-23
- Explanation
- Non évalué
- Pass
- No
- Statement
- producteur: UMR LEM - BPOE. Des ADN de fèces ont été extraits et envoyés à séquencer par novogene pour la région V4 de l'ARNr 16s. Les tables de contingences ont ensuite été réalisées. Les séquences sont assignés taxonomiquement et le nombre d'asv pour chaque échantillons est compté.
- File identifier
- 49ca99a7-6e54-48f8-ac75-a15116f1a308 XML
- Metadata language
- Français
- Character set
- UTF8
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2026-02-05T16:02:22
- Metadata standard name
- ISO 19115:2003/19139
- Metadata standard version
- 1.0
Overviews
Spatial extent
Provided by
