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Microbiologie du bassin-versant Ratier de l'Yzeron: analyse qPCR des biofilms se développant sur germcatchers (billes d'argile), campagne 2022

- DESCRIPTION DE LA DONNÉE:

Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron via l'utilisation de pièges passifs (billes d'argile / germcatchers) favorables au développement de biofilms. Les germcatchers ont été positionnés à l'exutoire du Ratier

- FORMAT

Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement des germcatchers (billes d'argile) étudiés

- CONTEXTE (DANS LE CADRE DE QUEL PROJET? QUI EST LE PROPRIÉTAIRE?...)

Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales dont les ruissellements urbains

- BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?)

Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon.

- LIEU

exutoire du bassin-versant du Ratier

- PÉRIODE

positionnement en rivière de germcatchers entre Avril - juin 2022

Simple

Date (Creation)
2022-12
Purpose
Validation du dispositif billes - d'argile / germcatchers en rivière
Status
Under development
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Point of contact
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Laurence Marjolet
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Principal investigator
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Angélique Dominguez Lage
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Maintenance and update frequency
As needed
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Habitats et biotopes
  • Répartition des espèces
GEMET
  • gestion des eaux superficielles
  • assainissement urbain
  • pollution
  • eau pluviale
  • eau
theme.OZCAR-Theia.rdf
  • Bacteria and virus diversity
  • Surface runoff
  • Bacteria and virus abundance
  • Variables
  • Escherichia coli
Keywords
  • SNO Observil
  • ZABR
Sites OTHU
  • Bassin versant de l'Yzeron
Access constraints
Copyright
Use constraints
Copyright
Other constraints
Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Topic category
  • Environment
  • Inland waters
Begin date
2022-04-01
End date
2022-07-01
Description
Bassin versant de l'Yzeron
Description
Bassin versant de l'Yzeron
N
S
E
W
thumbnail


Distribution format
  • txt/csv ( MST qPCR Germcatchers Exutoire Ratier v1 )

OnLine resource
Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
OnLine resource
OTHU site web ( WWW:LINK-1.0-http--related )

OTHU site web

Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date (Creation)
2022-11-23
Explanation
Non évalué
Pass
Yes
Statement
producteur: UMR LEM - BPOE; qPCR MST sur ADN de germcatchers; ADN extraits de germcatchers/billes d'argile incubées sur différente période en rivière à l'exutoire du Ratier; données brutes de quantités de copies d'un ADN cible selon unités indiquées dans le tableau xls et normalisation (ratio) sur des cibles de référence (16S rRNA gene ou cible Bacteroidales général)
File identifier
9a39c1aa-c269-4b5b-9ff2-f9239a9a04ce XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Parent identifier
Site du bassin versant de l'Yzeron 263968b1-9b85-4342-bd64-a020b041e8ab
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2023-03-27T07:23:28
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  OTHU - Nicolas WALCKER
Villeurbanne , 69100 , France
http://graie.org/othu/index.htm
 
 

Overviews

Spatial extent

N
S
E
W
thumbnail


Keywords

GEMET
assainissement urbain eau eau pluviale gestion des eaux superficielles pollution
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Habitats et biotopes Répartition des espèces
theme.OZCAR-Theia.rdf
Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity Escherichia coli Surface runoff Variables

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