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Qualité microbiologique – adaptation de l’approche idexx pour étudier les taux de bactéries résistantes (et multi-résistantes) aux antibiotiques sur les surfaces de la Métropole de Lyon et dans les eaux de ruissellement

Description détaillée :

Des données de quantification bactérienne ont été obtenues pour 4 groupes bactérien (hétérotrophes, Entérocoques, E.coli et Pseudomonas aeruginosa) avec la méthode cultivable et normalisée IDEXX, sur sédiments et eaux de ruissèlement urbains collectés au site Django-R. La population microbienne multirésistante de plusieurs de ces groupes à également été quantifiée.

- FORMAT

Tableau excel avec onglets indiquant les données physicochimiques, les quantifications microbiologiques selon les matrices et les points de prélèvement des sédiments étudiés.

- CONTEXTE :

Les données présentées ont été produites par l’équipe UMR LEM–BPOE dans le cadre des projets de l’OTHU, dédiés à l’analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales, en particulier les ruissellements urbains.

L’objectif de ces travaux est d’évaluer la contamination microbiologique de ces milieux ainsi que la présence de bactéries tolérantes ou résistantes aux antibiotiques, à partir de matrices solides (sédiments) et liquides (eaux de ruissellement).

Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans

- LIEU : Métropole de Lyon et périphérie

- PÉRIODE :entre novembre 2025 et janvier 2026

Simple

Date (Creation)
2025-11
Purpose
Caractériser la population microbienne sur les surfaces urbaines et le danger sanitaires associé (notamment sur la résistance aux antibiotique)
Status
On going
Owner
  Université Lyon 1 / VetAgro Sup - LEM BPOE - Benoit COURNOYER
France
http://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/spip.php?rubrique1
Custodian
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON
Author
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON
Maintenance and update frequency
As needed
Author
  CNRS / VetAgro Sup- LEM BPOE - Baptiste LUTON
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Installations de suivi environnemental
GEMET
  • eau pluviale
  • antibiotique
  • micro-organisme
  • pollution de la ville
  • sédiment
theme.OZCAR-Theia.rdf
  • Bacteria and virus abundance
  • Bacteria and virus diversity
Keywords
  • SNO Observil
  • ZABR
Sites OTHU
  • Chassieu Rétention/Infiltration
Emprises du Grand Lyon et périphériques
  • Emprises GrandLyon
Use limitation
Accord de réutilisation de données en accès privé et exclusif
Access constraints
Copyright
Use constraints
Other restrictions
Other constraints
Accessibles aux membres de l'OTHU et/ou sous convention

Spatial resolution

No information provided.
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Topic category
  • Environment
  • Inland waters
Begin date
2025-11-01
End date
2026-01-20
Description
Chassieu Rétention/Infiltration
N
S
E
W
thumbnail


Distribution format
  • txt/csv ( )

OnLine resource
Licence Ouverte ( WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download )
OnLine resource
OTHU site web ( WWW:LINK-1.0-http--related )

OTHU site web

Hierarchy level
Dataset

Conformance result

Date (Publication)
2010-11-23
Explanation
Non évalué
Pass
No
Statement
producteur: UMR LEM - BPOE; dénombrement de bactéries viables issues d'eau de surface ou de sédiments, quantification réalisée par la méthode IDEXX en présence ou non d'antibiotiques. Les données brutes étaient des comptage de puits fluorescent sur plaque IDEXX. Ensuite ces données ont été entrées sur le logiciel IDEXX MNP Générator qui convertit les résultats sous la forme de nombre le plus probables. Et pour finir ces données on été normalisé par 100 mL ou par gramme de poids sec. Les données physicochimiques mesurées sont aussi indiquées.
File identifier
a6ef42de-d1f1-4caa-962a-d31e07ef44c8 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2026-02-05T14:41:54
Metadata standard name
ISO 19115:2003/19139
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  OTHU - Nicolas WALCKER
Villeurbanne , 69100 , France
http://graie.org/othu/index.htm
 
 

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Spatial extent

N
S
E
W
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Keywords

GEMET
antibiotique eau pluviale micro-organisme pollution de la ville sédiment
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Installations de suivi environnemental
theme.OZCAR-Theia.rdf
Bacteria and virus abundance Bacteria and virus diversity

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