- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : (données ponctuelles par sites) données : infiltration, couverture végétale, plants species, soil microbiology (taxa abundance, diversity), soil texture, soil structure, porosity, site geometry, occupation des sols - FORMAT : tableau de données - CONTEXTE : Projet europpéen BIORESTORM & thèse de doctorat - BUT : Amelioration de la compréhension des mecanismes biologiques qui influencent la fonction infiltration des solution fondées sur la nature pour la gestion de l'eau pluviale en ville - LIEU : DJANGO et autres noues non suivies par l'OTHU (LYON) - PÉRIODE : été 2025 et 2026

L'équipe LEHNA-IPE développe depuis de nombreuses années des outils et méthodes infiltrométriques pour la caractérisation hydraulique des sols. Diverses applications ont été réalisées dans le cadre de l’OTHU (Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine, http://www.graie.org/othu/), dont la caractérisation des sols et matériaux constitutifs des dispositifs infiltrants suivis par cet observatoire (bassins d'infiltration, tranchées, noues, jardins de pluie, etc.). Mais, ces techniques demandent des adaptations des techniques infiltrométriques pour les matrices très perméables constitutrices des techniques alternatives. Dans le cadre de cette étude, des infiltromètres automatisés et interconnectés ont été réalisés (deux séries de 5 infiltromètres automatisés et interconnectés par système d'acquisition) pour un total de 10 infiltromètres et deux bases d’acquisition. Les infiltromètres ont été testés dans trois sites (bassin d’infiltration Django Reinhardt, ENTPE et site de la Doua) dans diverses configurations notamment météorologiques (conditions sèches et conditions humides après un évènement pluvieux). Ces essais ont permis de valider le dispositif et de tester plusieurs protocoles d’extraction et de traitement de la données infiltrométriques.

Evaluation des performances hydrauliques de techniques alternatives (noue, tranchée) Paramètres hydrauliques: débits (augets, électromagnétiques) depuis 2017 Paramètres physico-chimiques: Température et conductivité électrique de 2017 à juin 2019

Campagne de collectes de sédiments sur plusieurs bassins d'infiltration de la métropole Mesures des quantité de raticides dans les matrices sédimentaires Evaluation en laboratoire de l'impact des raticides sur un organisme sentinelle aquatique vivant dans ces sédiments (le vers tubificidé Tubifex tubifex) Mesures écophysiologiques réalisées : réserves énergétiques chez les organismes + à compléter

- DESCRIPTION DE LA DONNÉE: Des données ont été produites via la boîte à outils qPCR de l'OTHU permettant d'étudier l'occurrence et l'origine d'espèces bactériennes indicatrices d'une contamination fécale sur le BV Yzeron via l'utilisation de pièges passifs (billes d'argile / germcatchers) favorables au développement de biofilms. Les germcatchers ont été positionnés à l'exutoire du Ratier - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les unités de mesure et points de prélèvement des germcatchers (billes d'argile) étudiés - CONTEXTE (DANS LE CADRE DE QUEL PROJET? QUI EST LE PROPRIÉTAIRE?...) Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales dont les ruissellements urbains - BUT (A QUOI A-T-ELLE SERVI? QUELLE EXPLOITATION?) Ces données sont utilisées dans le contexte de projets pluridisciplinaires concernant les sources de contaminants impactant les bassins-versants d'usage mixte sur le secteur de la métropole de Lyon. - LIEU exutoire du bassin-versant du Ratier - PÉRIODE positionnement en rivière de germcatchers entre Avril - juin 2022

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données physicochimiques sur des sédiments urbains (pH, poids sec, ions, éléments traces métallique, N, P, Hydrocarbure aromatique polycyclique) échantillonnés sur 9 zones de la métropole de Lyon (avec 3 typologies) pendant 3 saisons. Ces données sont associées à d'autres concernant la qualité microbiologique de ces sédiments via qPCR des ADN avec les marqueurs de la trousse OTHU. Ces données sont complétées par des images produites par microscopie électronique à balayage des microorganismes présents. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (paramètres généraux, pH, Chimie, ADN, quantification qPCR) - CONTEXTE : L'étude des sédiments urbains en terme microbiologique et physicochimiques permets de faire le lien entre chimie et présence de microorganismes, et en particulier de pathogènes. Ces données sont associés à des images de microscopie électronique à balayage pour visualiser la diversité des formes microbiennes et les rendre accessibles au publique. Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des sédiments urbains remobilisés par temps de pluie au niveau de la métropole. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : métropole de Lyon - PÉRIODE : novembre 2023 à juin 2024

Données produites depuis 2021 dans le cadre de l'OTHU pour le suivi des paramètres météorologiques. Station météo:Campbell SCI CR1000. Paramètres suivis: température, humidité de l'air, ensoleillement, vitesse et orientation du vent et pluviométrie.

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données de séquençage du segment V4 de du gène de l’ARNr 16S pour les pelotes fécales de 5 mammifères (homme, chat, chien, mouton, campagnol) - FORMAT : Tableau Excel contenant le descriptif des échantillons, et les tables de contingence. - CONTEXTE : Ces données ont été produites dans le cadre des activités de l'OTHU et s'inscrivent dans les travaux multidisciplinaires de BPOE-LEM. Le but est la création d'une base de données de référence du gène 16S rRNA pour pouvoir par la suite identifier les sources de contamination fécale dans la métropole de Lyon. Cette base de données sera enrichie au fil du temps dès de nouveaux échantillons seront obtenus. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - LIEU : Métropole de Lyon, Auvergne - PÉRIODE : 2025-maintenant

Validation du dispositif métrologique Description des données : - Hauteur eaux de surface amont et aval du déversoir d'orage (DO / CSO) - Débit DO / CSO - pH, turbidité, température, conductivité électrique

Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm