- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : (données ponctuelles par sites) données : infiltration, couverture végétale, plants species, soil microbiology (taxa abundance, diversity), soil texture, soil structure, porosity, site geometry, occupation des sols - FORMAT : tableau de données - CONTEXTE : Projet europpéen BIORESTORM & thèse de doctorat - BUT : Amelioration de la compréhension des mecanismes biologiques qui influencent la fonction infiltration des solution fondées sur la nature pour la gestion de l'eau pluviale en ville - LIEU : DJANGO et autres noues non suivies par l'OTHU (LYON) - PÉRIODE : été 2025 et 2026

- description générale: données de qualité (protéines totales, INT - respiration, FDA - métabolisme générale) concernant la formation de biofilms sur germcatchers en rivière (BV Ratier/Mercier de l'Yzeron) associées à des données produites à partir d'ADN extraits de ces biofilms. Des jeux de données concernant la qualité microbiologique des biofilms (via l'ADN) ont été produits par qPCR et méta-barcoding d'amplicons du gène marqueur tpm. Des eaux de surface ont été analysées durant cette étude pour qualifier les périodes d'échantillonnage en termes de paramètres physico-chimiques et permettre des comparaisons entre microbiologie des biofilms et des eaux de surface (uniquement via qPCR et méta-barcoding d'amplicons). - format des données: tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (biofilms, ADN, eaux de surface - physico-chimie) - contexte: L'étude des biofilms sur germcatchers permet de tester les aptitudes des bactéries de sources exogènes (animales, surverse de réseau unitaire) dont des formes pathogènes à coloniser les compartiments d’un cours d’eau dans un contexte (i) de compétition avec les composantes biologiques naturelles du cours d’eau mais également (ii) d’exposition à de multiples polluants chimiques dont des phytosanitaires et pharmaceutiques. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans. - lieu: bassin-versant de l'Yzeron (69, France) - période: mars à juin 2023

Evaluer l’exposition des populations avoisinantes et des opérateurs du bassin à des bioaérosols bactériens. Etude de la formation bioaérosols en amont du bassin, dans le bassin et en aval en fonction de la saison (4 saisons), de la vitesse du vent (fort vent, peu de vent), et des activités anthropiques (brassage des sédiments, sans brassage). Description de la donnée : - méthodes cultivables : concentrations des bactéries totales cultivables, des entérocoques, des coliformes totaux, E. coli, Nocardia genre. - NPP PCR pour les deux pathogènes opportunistes A. caviae et P. aeruginosa. - Extractions d’ADN et PCR : entérocoques, A. caviae, P. aeruginosa, Nocardia genre, N. farcinica, N. cyriacigeorgica - Séquençage massif 16S et tpm

L'équipe LEHNA-IPE développe depuis de nombreuses années des outils et méthodes infiltrométriques pour la caractérisation hydraulique des sols. Diverses applications ont été réalisées dans le cadre de l’OTHU (Observatoire de Terrain en Hydrologie Urbaine, http://www.graie.org/othu/), dont la caractérisation des sols et matériaux constitutifs des dispositifs infiltrants suivis par cet observatoire (bassins d'infiltration, tranchées, noues, jardins de pluie, etc.). Mais, ces techniques demandent des adaptations des techniques infiltrométriques pour les matrices très perméables constitutrices des techniques alternatives. Dans le cadre de cette étude, des infiltromètres automatisés et interconnectés ont été réalisés (deux séries de 5 infiltromètres automatisés et interconnectés par système d'acquisition) pour un total de 10 infiltromètres et deux bases d’acquisition. Les infiltromètres ont été testés dans trois sites (bassin d’infiltration Django Reinhardt, ENTPE et site de la Doua) dans diverses configurations notamment météorologiques (conditions sèches et conditions humides après un évènement pluvieux). Ces essais ont permis de valider le dispositif et de tester plusieurs protocoles d’extraction et de traitement de la données infiltrométriques.

- DESCRIPTION DÉTAILLÉE : Données physicochimiques sur des sédiments urbains (pH, poids sec, ions, éléments traces métallique, N, P, Hydrocarbure aromatique polycyclique) échantillonnés sur 9 zones de la métropole de Lyon (avec 3 typologies) pendant 3 saisons. Ces données sont associées à d'autres concernant la qualité microbiologique de ces sédiments via qPCR des ADN avec les marqueurs de la trousse OTHU. Ces données sont complétées par des images produites par microscopie électronique à balayage des microorganismes présents. - FORMAT : tableaux excel avec onglets donnant accès aux différents jeux de données (paramètres généraux, pH, Chimie, ADN, quantification qPCR) - CONTEXTE : L'étude des sédiments urbains en terme microbiologique et physicochimiques permets de faire le lien entre chimie et présence de microorganismes, et en particulier de pathogènes. Ces données sont associés à des images de microscopie électronique à balayage pour visualiser la diversité des formes microbiennes et les rendre accessibles au publique. Les données ont été produites par l'équipe UMR LEM - BPOE dans le cadre des projets OTHU concernant l'analyse de la qualité microbiologique des sédiments urbains remobilisés par temps de pluie au niveau de la métropole. Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : métropole de Lyon - PÉRIODE : novembre 2023 à juin 2024

Évaluation des performances hydrauliques de techniques d'un parking asphalté et d'une chaussée poreuse Paramètres hydrauliques: débits (augets, électromagnétiques) depuis 2017 Paramètres physico-chimiques: Température et conductivité électrique de 2017 à juin 2019

Données produites depuis 2004 dans le cadre de l'OTHU afin de caractériser les flux d'eau et de polluants au sein d'un déversoir d'orage d'un bassin versant résidentiel. Autosurveillance pour la Métropole de Lyon. Paramètres hydrauliques: débits (Hauteurs/vitesses), pluviométrie (2004 à 2019) Paramètres physico-chimiques: conductivité électrique, température, pH, turbidité (2004 à 2012)

Validation du dispositif métrologique Description des données : - Hauteur eaux de surface amont et aval du déversoir d'orage (DO / CSO) - Débit DO / CSO - pH, turbidité, température, conductivité électrique

Description détaillée : Des données de quantification bactérienne ont été obtenues pour 4 groupes bactériens (hétérotrophes, entérocoques, E.coli et Pseudomonas aeruginosa) avec la méthode cultivable et normalisée IDEXX, sur sédiments et eaux de ruissellement urbains collectés au site Django-R. La population microbienne multirésistante de plusieurs de ces groupes a également été quantifiée. - FORMAT Tableau excel avec onglets indiquant les données physicochimiques, les quantifications microbiologiques selon les matrices et les points de prélèvement des sédiments étudiés. - CONTEXTE : Les données présentées ont été produites par l’équipe UMR LEM–BPOE dans le cadre des projets de l’OTHU, dédiés à l’analyse de la qualité microbiologique des milieux impactés par les pratiques de gestion des eaux pluviales, en particulier les ruissellements urbains. L’objectif de ces travaux est d’évaluer la contamination microbiologique de ces milieux ainsi que la présence de bactéries tolérantes ou résistantes aux antibiotiques, à partir de matrices solides (sédiments) et liquides (eaux de ruissellement). Ces données sont la propriété de l'OTHU et de l'équipe BPOE de l'UMR Ecologie Microbienne, et sont sous embargo jusqu'à publication dans une revue scientifique ou pendant une période de 5 ans - LIEU : Métropole de Lyon et périphérie - PÉRIODE :entre novembre 2025 et janvier 2026

Incubation de supports artificiels (billes d'argile) pour échantillonner les microorganismes dans la nappe sur 2 sites en amont et aval de bassins d'infiltration (Django-Reinhardt et l'IUT) Campagne de collectes d'eau et de substrats artificiels (billes d'argile) lors de l'incubation (7 temps pour les eaux et 5 temps pour les supports artificiels) Mesures réalisées: - Dynamique des nutriments (NO3, NH4, PO4) du carbone organique dissous total et biodégradable - Dynamique structurelle des communautés bactériennes : analyses de métabarcoding 16S - Dynamique fonctionnelle des communautés microbiennes : activités microbiennes (hydrolytique FDA et respiratoire INT)